COUPLING FOCUS
STACKING WITH PHOTOGRAMMETRY TO ILLUSTRATE SMALL FOSSIL TEETH
Michael Santella1 & Andrew R. C.
Milner1
1 - St. George
Dinosaur Discovery Site at Johnson Farm, St. George, Utah, USA
Emails: mls
antella@gmail.com (MS), arcmilner@gmail.com (AM)
ABSTRACT
A macrophotography
technique coupled with focus stacking was used to produce source images for
photogrammetry of two isolated fossil teeth from the Lower Jurassic Kayenta
Formation of southwest Utah. The crown heights of the teeth are approximately 4
mm and 9 mm. The macrophotography was conducted using a Canon digital camera
body with a 24-megapixel APS-C sensor. The camera body was attached to a Canon
MP-E 65mm lens. A Cognisys focusing rail coupled to a rotation stage was used to
manipulate specimens for photography. Focus stacking with Helicon Focus 6
software was used to produce completely focused images for input to Agisoft
Photoscan photogrammetry software. The scaled three-dimensional representations
created by photogrammetry are available at
https://figshare.com/s/d205f5bee8cb2767f902 for specimen UMNH VP 25852 and
https://figshare.com/s/af8b4e74db21606a91bd, for specimen UMNH VP 25853.
Judging by appearances, retention in the three-dimensional models of shape and
surface details from the two-dimensional input images was excellent. A stereo
lithography file was also exported for UMNH VP 25852 model, and it was used to
produce a 3D-printed model. Regarding identification of the teeth, specimen UMNH
VP 25852 has features associated with small theropod dinosaurs. Specimen UMNH VP
25853 has features associated with ornithischian dinosaurs. However, without
reference to skeletal remains neither tooth could be unambiguously associated
with a specific taxon.
RESUMO [in
Portuguese]
Uma técnica de
macrofotografia associada ao empilhamento de focagem foi usada para produzir
imagens de origem para fotogrametria de dois dentes fósseis isolados, da
Formação Kayenta do Jurássico inferior do sudoeste de Utah. A altura das coroas
dos dentes é de aproximadamente 4 mm e 9 mm. A macrofotografia foi conduzida
usando um corpo de câmara digital Canon, com um sensor APS-C de 24 megapixels. O
corpo da câmara foi acoplado a uma lente Canon MP-E 65mm. Um Cognisys com
carreto de focagem acoplado a um mecanismo de rotação foi usado para manipular
os espécimes para a fotografia. O empilhamento de imagens com diferentes focagem
foi realizado com o software Helicon Focus 6 para produção de imagens
completamente focadas para serem inseridas no software de fotogrametria Agisoft
Photoscan. As representações tridimensionais escalonadas criadas pela
fotogrametria estão disponíveis em https://figshare.com/s/d205f5bee8cb2767f902
para o espécime UMNH VP 25852 e https://figshare.com/s/af8b4e74db21606a91bd,
para o espécime UMNH VP 25853. Ao que parece, a retenção nos modelos
tridimensionais dos detalhes da forma e da superfície das imagens bidimensionais
da entrada foi excelente. Um arquivo de litografia estéreo também foi exportado
para o modelo UMNH VP 25852, e foi usado para produzir um modelo impresso em 3D.
Quanto à identificação dos dentes, o espécime UMNH VP 25852 tem características
associadas a pequenos dinossauros terópodes. O espécime UMNH VP 25853 tem
características associadas com dinossauros ornitisquios. No entanto, sem
associação a um esqueleto permanece ambos os dentes não podem ser
inequivocamente associados com um taxon específico.
How
to cite this paper: Santella, M. and Milner, A.R.C. (2017). Coupling focus
stacking with photogrammetry to illustrate small fossil teeth. Journal of
Paleontological Techniques, 18:1-17.
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